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日本圖書紙質市場的嚴重萎縮，讓日本出版機構逐漸與其他出版企業聯合經營，達到資金、人力、資訊等資源的有效利用，并探索數位化轉型模式，以謀取出路。例如小學館(株式會社小學館)、集英社(株式會社集英社)和白泉社(株式會社白泉社)成立的一橋集團（一ツ橋グループ）；講談社(株式會社講談社)聯合 King Records(キングレコード)、光文社（こうぶんしゃ）、日刊現代(日刊ゲンダイ)、星海社(星海社)聯合成立的羽音集團（音羽グループ）；以角川書店(株式會社角川書店)為核心所成立的角川集團（株式會社角川グループホールディングス），也是日本出版界唯一的上市公司；以新潮社(株式會社新潮社)、Coamix(株式會社コアミックス)、大泉書店(株式會社おおいずみしょてん)和 PICO House(株式會社ピコハウス)為主的出版社聯合成立出版集團。出版機構聯合經營后實力大幅提升，僅講談社、小學館和集英社三社就占漫畫出版市場總額的三分之二。為了提升實體書店之銷售，不少日本出版社便集資投資書店，例如2011~2012年間，小學館、講談社、集英社各自出資一千多億日圓，投資日本最大的二手書店 Book of Coorporation。出版業者也漸漸的透過網路行銷，來增加其銷售量，截至 2010 年日本圖書雜志的網路銷售總額已占全部圖書銷售總額的 6.7%。除此之外，2011 年，主婦與生活社(主婦と生活社)、三和書籍等八家出版社聯合成立了一家電子書店“Bookpub”的，并銷售集結八家出版社之精品圖書。而新潮社則聯合集英社等大型出版社共同建立了“電子文庫 PABURI”(電子文庫パブリ)。講談社、新潮社、讀賣新聞(読売新聞)等日本知名的新聞出版機構與索尼公司(ソニー株式會社，Sony Corporation)共同組成了專門發行電子圖書的服務公司“Publishing link”。加盟日本最大的電子圖書銷售網站“PAPYLESS”的出版社也有兩、三百家，其中不乏包括角川書店、講談社等大型出版社。日本電子書店領域在報業加入后，使得圖書種類更為完善，服務體系也更加齊全。
與歐美等已開發國家相比，日本數位化轉型相對落后許多，這與「再販制度」下的日本圖書市場較為穩定有關系。出版社透過圖書批發公司把圖書販售給書店(第一次銷售)，書店把圖書賣給讀者(第二次銷售)。「再販制」是一種圖書固定價格銷售制度，出版社指定圖書價格，并經由批發公司監督書店執行，書店無權漲價或降價販售。這種出版物流通形式屬于出版社透過圖書批發公司委托書店銷售，因此，與「再銷售制度」相配套的是「委托銷售制度」。在此制度下，書店從圖書批發公司進貨，待六個月后可以退銷售不完的貨，下個月再對圖書批發公司及出版社進行結算付款。隨著資訊技術日新月異及全球的數位化的普及、網路化鋪天蓋地襲卷而來，日本出版業在情勢所逼下得在內容生產、行銷管道等各個環節上進行數位化改革。第一透過運營商聯合開拓手機閱讀群，獲得特定的市場讀者，同時爭取新的數位內容管道收入；第二是將出版流程全面數位化，例如通過網路搜集圖書選題和稿件，并將同一數位化內容在多個數位終端設備上同步或不同步播放，實踐內容資源的多次利用；第三則是接受網路預訂和案量印刷，借由網路預訂，出版社能夠準確預估圖書的起印量，讀者也能夠透過分期付款的方式來購書，激化讀者對網路預訂意愿，出版社不但可有效預測及印制書籍，還可對網路預購的讀者進行消費者行為數據分析。
